什么是內(nèi)毒素？

細菌內(nèi)毒素是革蘭氏陰性菌細胞壁上的一種脂多糖（LipopolySaccharide,LPS）和蛋白的復合物，當細菌裂解時便會大量釋放出來。內(nèi)毒素單位為EU。

內(nèi)毒素對試驗的影響

內(nèi)毒素存在極大程度地影響轉(zhuǎn)染效率。同時內(nèi)毒素還可能激活免疫細胞的非特異反應(yīng)，造成實驗中的假陽性。因此，為了保證高轉(zhuǎn)染率和轉(zhuǎn)染細胞高存活率，必須從質(zhì)粒制備的過程中將內(nèi)毒素去除。

內(nèi)毒素和質(zhì)粒的關(guān)系

由于內(nèi)毒素兩親性和負電荷性，性質(zhì)類似于DNA，因此在質(zhì)粒純化中會伴隨質(zhì)粒一同被純化出來。質(zhì)粒中內(nèi)毒素含量的高低常用EU/µg質(zhì)粒表示。

按照EU/µg大小，質(zhì)粒被分為三個級別：測序級別（>50EU/µg）、轉(zhuǎn)染級別(<50EU/µg)和無內(nèi)毒素級別(<0.1EU/µg)。

再次強調(diào)

當你提取的質(zhì)粒DNA是為了轉(zhuǎn)染原代細胞、懸浮細胞或者敏感細胞；進行基因沉默研究、細胞注射顯微操作；進行基因治療或者DNA疫苗等要求極為嚴格的實驗，就應(yīng)該考慮Endotoxin-Free的質(zhì)粒。

2017年3月，張鋒課題組在《Nature Protocols》發(fā)表的《Genome-scaleCRISPR-Cas9 knockout and transcriptional activation screening》中，Endotoxin-Free的質(zhì)粒獲得被列為 Critical Step，同時推薦該廠家的NucleoBond Endotoxin Free Plasmid DNA kit，可避免病毒包裝和細胞培養(yǎng)過程中減少了內(nèi)毒素殘留的影響。